Fe2+、Fe3+
カタラーゼの補助因子として用いられる。過酸化水素の分解の際に働く。下は様々な種類のカタラーゼであるが、内部にヘム（鉄イオンを含む）が組み込まれている。
Cu2+
シトクロムオキシダーゼの補助因子として用いられる。電子の運搬の際に働く。シトクロムオキシダーゼはいくつかのユニットの複合体であるが、その一部でに銅イオンが組み込まれている（下画像）
Zn2+
脱水素酵素の補助因子として用いられる。水素の転移の際に働く。下画像の赤丸はアルコール脱水素酵素内の亜鉛イオン。
Ni2+
ウレアーゼの補助因子として用いられる。ウレアーゼの12個の活性部位に２つずつニッケルイオンが組み込まれている。尿素の加水分解の際に働く。
