細胞分画法
細胞内の内容物を調べる方法である。細胞をすり棒ですり潰し、内容物をバラバラにする（内容物の構造は壊さない程度に）。その溶液を遠心分離器にかけることによって、密度の高いものから早くに沈殿していく。さらにその上澄みを遠心分離し…の作業を繰り返していく。
次の順で沈殿していく。
核→葉緑体（植物細胞）→ミトコンドリア→リボソーム、小胞体
同位体を利用した方法
同位体の中でも放射線を出す放射性同位体は、物質の動きを追跡するのに便利である。ある同位体を含む物質を細胞に取り込ませることによって、どこでその物質が利用されているのかを知ることができる。例えば、同位体3Hを含むチミジン（チミンとデオキシリボースが結合した物質）を細胞に取り込ませた所、核内にチミジンが移動した。この結果から、DNAの合成は核内で行われていることがわかる。
チミジンはRNAには使用されないため（RNAはTの代わりにU）、放射性同位体3Hを含むチミジンどれだけ吸収されたかによって、DNAの複製量を知ることができる。
細胞に取り込まれるチミジンの量は細胞増殖能と関係があり、細胞増殖分析として広く知られている方法です。
http://www.dojindo.co.jp/
GFPを用いた方法
ある遺伝子にGFP（蛍光タンパク質）の遺伝子を挿入することによって、その物質がどのように発現し、どのような構造をしているのかを知ることができる。例えば、微小管にGFPを結合させることによって、細胞分裂時に微小管がどのような構造・動きをするのかをリアルタイムで知ることができる。
